Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pgpep1Q9ESW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgpep1Q9ESW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgpep1Q9ESW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms