Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ParvgQ9ERD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ParvgQ9ERD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ParvgQ9ERD8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ParvgQ9ERD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms