Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snap29Q9ERB0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snap29Q9ERB0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap29Q9ERB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms