Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RhojQ9ER71 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RhojQ9ER71 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhojQ9ER71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms