Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TnmdQ9EP64 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TnmdQ9EP64 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TnmdQ9EP64 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TnmdQ9EP64 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms