Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne8Q9DC53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne8Q9DC53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne8Q9DC53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms