Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Swt1Q9DBQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Swt1Q9DBQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms