Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smco2Q9DA21 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smco2Q9DA21 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms