Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc70Q9D9B0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc70Q9D9B0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc70Q9D9B0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms