Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot8Q9D8X5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot8Q9D8X5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms