Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cul5Q9D5V5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cul5Q9D5V5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul5Q9D5V5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms