Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4931423N10RikQ9D4J9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931423N10RikQ9D4J9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms