Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efhc2Q9D485 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efhc2Q9D485 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efhc2Q9D485 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms