Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpn3Q9D3W4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpn3Q9D3W4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9591.9 ms