Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy3Q9D394 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy3Q9D394 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy3Q9D394 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy3Q9D394 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms