Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl53Q9D1H8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms