Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2cQ9D1C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2cQ9D1C1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms