Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl28Q9D1B9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms