Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyc1Q9D0M3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cyc1Q9D0M3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cyc1Q9D0M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms