Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shisa9Q9CZN4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisa9Q9CZN4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisa9Q9CZN4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms