Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssbp1Q9CYR0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssbp1Q9CYR0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms