Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx7Q9CY18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx7Q9CY18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx7Q9CY18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms