Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufaf1Q9CWX2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufaf1Q9CWX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms