Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxxc1Q9CWW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxxc1Q9CWW7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxxc1Q9CWW7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms