Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CWU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CWU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CWU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CWU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CWU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CWU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CWU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CWU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms