Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx28Q9CWT6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx28Q9CWT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx28Q9CWT6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms