Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Sycp2Q9CUU3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Sycp2Q9CUU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Sycp2Q9CUU3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Sycp2Q9CUU3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Sycp2Q9CUU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Sycp2Q9CUU3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms