Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otud1Q9CUB6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud1Q9CUB6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms