Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Six6os1Q9CTN5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six6os1Q9CTN5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six6os1Q9CTN5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six6os1Q9CTN5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms