Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fcf1Q9CTH6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcf1Q9CTH6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcf1Q9CTH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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