Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ykt6Q9CQW1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ykt6Q9CQW1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.7 ms