Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms