Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc18Q9CQ07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc18Q9CQ07 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms