Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep41Q99NF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cep41Q99NF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cep41Q99NF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.1 ms