Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim11aQ99J19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim11aQ99J19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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