Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Med1Q925J9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Med1Q925J9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Med1Q925J9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Med1Q925J9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Med1Q925J9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms