Protein–RNA interactions for Protein: Q922U2

Krt5, Keratin, type II cytoskeletal 5, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt5Q922U2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt5Q922U2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt5Q922U2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt5Q922U2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms