Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6cQ91ZQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms