Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l3Q91XE9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Creb3l3Q91XE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Creb3l3Q91XE9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Creb3l3Q91XE9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Creb3l3Q91XE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms