Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd3Q91WC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Setd3Q91WC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Setd3Q91WC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Setd3Q91WC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms