Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx9Q91VH2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx9Q91VH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx9Q91VH2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx9Q91VH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms