Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps3Q91VB4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hps3Q91VB4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps3Q91VB4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps3Q91VB4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms