Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacng5Q8VHW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacng5Q8VHW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacng5Q8VHW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms