Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup58Q8R332 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nup58Q8R332 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup58Q8R332 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms