Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf183Q8QZS5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Rnf183Q8QZS5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf183Q8QZS5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rnf183Q8QZS5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf183Q8QZS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms