Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc12Q8K5B8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms