Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casc3Q8K3W3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casc3Q8K3W3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casc3Q8K3W3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms