Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Champ1Q8K327 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Champ1Q8K327 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Champ1Q8K327 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Champ1Q8K327 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms