Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcho1Q8K285 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fcho1Q8K285 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcho1Q8K285 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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