Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf628Q8CJ78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms